九三学社是以科学技术界高、中级知识分子为主的具有政治联盟特点的参政党。1944年底，一批文化教育、自然科学学者在中国共产党支持和抗日民族统一战线政策感召下，于重庆发起民主科学座谈会。1945年9月3日，为纪念抗日战争和世界反法西斯战争的伟大胜利，民主科学座谈会更名为九三座谈会，1946年5月4日，召开大会，将九三座谈会改称九三学社。

九三学社南京中医药大学委员会为我校成立较早的民主党派之一。1984年10月，九三学社江苏省直属支社南京中医学院小组成立，当时社员共有8位，由马禄君和恽敏两位同志分别担任组长和副组长。1991年5月，九三学社南京中医学院支社成立，开国维同志任支社主任委员，王锦鸿同志任支社副主任委员，共有社员36名。1995年10月，九三学社南京中医药大学支社第二届委员会成立，开国维同志任支社主委，王锦鸿、顾保群同志任支社副主任委员。2002年10月，九三学社南京中医药大学支社第三届委员会换届，王旭东同志任主任委员，熊宁宁同志、张宗明同志任副主任委员。2006年11月，九三学社南京中医药大学支社正式升格为九三学社南京中医药大学委员会，王旭东同志任主任委员，熊宁宁同志、张宗明同志任副主任委员。2015年10月，九三学社南京中医药大学委员会第二届换届，张宗明同志任主任委员，陆茵同志、吴明华同志任副主任委员。2021年4月，九三学社南京中医药大学委员会第三届换届，张宗明同志任主任委员，陆茵同志、吴明华同志任副主任委员。

九三学社南京中医药大学委员会第三届委员会成员如下：

主    委：张宗明

副主委：吴明华、陆茵

委   员：张稚鲲、潘涛、金黑鹰、孙鲁宁、李友白、王思特

下属三个支社及一个分委员会，分别为：南京中医药大学支社、南京中医药大学附院支社、南京中医药大学二附院支社、青年工作委员会。

九三学社南京中医药大学委员会在社省委及校党委领导下充分发挥参政议政功能，为我校的各项事业发展出谋划策，反映社情民意、积建言献策，充分发挥参政议政功能。近年来，我校社员获得多项荣誉，张宗明主委受到社中央的表彰，被评为先进个人，多位社员被九三学社江苏省委评为社会服务、宣传工作先进个人，九三学社南京中医药大学委员会也多次被九三学社江苏省委评为社情民意先进集体、社会服务先进集体。